Съдържание
Пептидите са фрагменти от къси полимери, съставени от аминокиселини. Всеки пептид има определена последователност от аминокиселини, обозначени с трибуквен код или само един; например аминокиселината аланин е съкратено като "Ala" или "A". Натоварването на пептидите в разтвора зависи от неговата киселинност. Изоелектричната точка (pI) се отнася до стойността на киселинността на разтвора, в който пептидната молекула има нетен заряд, равен на нула. Разтворимостта на пептида е минимална в изоелектричната точка. Използвайте наличните уеб сървъри, за да изчислите стойността на pI за аминокиселинна последователност на пептид.
Етап 1
Последователност на пептида с помощта на еднобуквен код. Например, ако пептидът има аминокиселинна последователност Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (аланин - серин - глутаминова киселина - левцин - пролин), тогава еднобуквената последователност ще бъде "ASELP". Ако е необходимо, вижте таблицата за преобразуване от една буква в три букви, предоставена в раздела „Ресурси“.
Стъпка 2
Използвайте всеки браузър, като Internet Explorer или Firefox, за да въведете сървър, който изчислява изоелектричната точка на пептид (pI); вижте Ресурси.
Стъпка 3
Въведете еднобуквената последователност на пептида - в нашия пример „ASELP“ - в полето и щракнете върху „Compute“.
Стъпка 4
Прочетете стойността на изоелектричната точка (pI), дадена в реда на "Теоретична pI / Mw" (теоретична pl). В нашия пример pI е 4.00. Имайте предвид, че сървърът също изчислява молекулното тегло (Mw) на пептида.